輔助調整過敏體質，減少過敏反應相關激素分泌，並提升脾臟細胞增生能力，改善腸道機能，改善便秘、消化功能的疾病，還可以改善免疫過敏、心血管、糖尿病、膽固醇代謝調節、改善私密處發炎症狀、癌症預防，甚至憂鬱症、慢性疲勞等心理疾病、預防腹瀉、 治療小腸細菌過度增生、降低齲齒、加速牛奶蛋白過敏的復原、減少異位性溼疹的發生。
益生菌種類百百種，對於每個人的腸道幫助效果卻大不相同，別以為有吃就有效，其實吃錯只是吃心安。
台灣因民眾飲食習慣的差異，以及各生活型態的不同，導致南北民眾，體內所需菌體也不同。根據診所研究統計，北部民眾，如要改善過敏情況，有百分之四十三的人適合的菌種為「嗜酸性乳酸桿菌」；改善自體免疫功能，百分之四十四的人適合「洛德乳酸桿菌」。
益生菌的種類
一、 形式
① 經由優酪乳等發酵食品攝取。
② 活菌冷凍乾燥粉末添加於嬰兒配方或牛奶中。
③ 膠囊等藥劑形式，菌量較多。
二、菌種
① 乳酸菌／調節腸道菌群平衡、提高免疫力、緩解乳糖不耐症等功效，而且具有降低血清膽固醇、預防心血管疾病的作用。
② 比非德氏菌／ 抑制腸道壞菌，是不會產生臭屁的菌種之一。
③ 嗜熱性鏈球菌／由生成物質消滅病菌，刺激人體免疫反應，與病菌競爭養分、或生存空間，來達成治療的效果。
新生兒益生菌如何補充
台中仁愛醫院家醫科楊逸精醫師表示，近期臨床研究可以確認，一些特定菌株的益生菌對於新生兒奶蛋白的過敏、腸絞痛、過敏性腸炎等，可以有所改善。美國病理學雜誌也指出，新生兒尚未成熟的腸道上皮細胞不具有屏障功能，小分子蛋白、細菌等容易透過腸道的隙縫進入血液循環，造成嬰幼兒及兒童奶蛋白的過敏、感染性或過敏性腸炎、腸絞痛等腸道問題，一項在微生物期刊發表的研究報告也顯示，益生菌株LGG可以健全腸道菌相，促進建構完整的腸道屏障功能，臨床使用可以防止腸道炎性疾病的發生，減少牛奶過敏患童的比例，且具有預防和治療的作用。因此，嬰幼兒補充具有臨床效益的益生菌株也越來越受到新生兒父母的重視。
楊逸精醫師建議，嬰幼兒補充益生菌可以選擇滴液的劑型，直接滴入小寶寶的口中，不僅方便，沒有拆開膠囊的困擾，且不用擔心污染的問題。對於不喜歡或是有困難吞嚥膠囊的對象，如孕婦、家中的長輩等，滴液劑型的益生菌產品也是另一項選擇。他也特別提醒，選擇相關產品一定要注意是否有充分臨床報告佐證，且不要添加乳化劑、抗結塊劑、佐味劑、防腐劑等，避免造成健康上的隱憂。
問與答Q&A
哪些時段食用益生菌比較有效？
食用益生菌時最好要能夠搭配像是水果之類的食物，並且建議在用餐完後2至3小時後，或是睡前3小時食用，主要是因為這些時候腸道的蠕動速度較慢，益生菌也最容易留得住。
未滿周歲嬰兒可以嘗試喝優酪乳嗎？
1歲以下的嬰兒，還不能喝優酪乳，最好的方式就是餵哺母乳，或者由合格的嬰兒配方奶中添加益生菌，以後天方式彌補無法餵母乳創造有益乳酸菌腸道環境的缺憾。
益生菌安全嗎？
目前為止，只有零星個案報告的菌血症或鰴菌血症發生在嚴重免疫缺陷或癌症轉移的病人，所以基本上說起來，益生菌作為生物治療劑是相當安全的。
每天吃益生菌希望調整體質，怎麼感覺效果越來越有限？
醣類不耐症或腹瀉，仍必須經由醫生診斷，循正規的治療，包括飲食和藥物，並在需要時配合使用益生菌才有幫忙，而非只依賴乳酸菌就會有效，不是光吃益生菌就有幫助，因為益生菌要能生長在腸道中，尚需寡糖、纖維素以及發酵的食物幫助提供益生菌營養來源。
想要補充益生菌，喝優酪乳最方便？
不一定要靠喝優酪乳來增加益菌，如果我們平常已經吃了很多蛋白質的食物如肉、蛋、魚等，再靠喝優酪乳來補充益菌，反而會增加身體蛋白質的負擔，要有健康的腸相，一定要記住要多吃蔬果，蔬果有很多膳食纖維，還有植化素 (phytochemicals)，都是促進身體健康的好物質。
一天吃好幾種益生菌保障免疫力、腸道健康、保養私密處，更可以促進功效？
益生菌的目的是要平衡身體內好菌與壞菌，所以不是越多越好，不管是市售的優酪乳或是膠囊，都需要依照上面的標示食用，優酪乳一天不要超過500c.c.，千萬不要認為益生菌很好就猛吃。
夏日悶熱引起婦女陰道發炎，益生菌也可以有效預防嗎？
女性的會陰、陰道，本來就存在一種乳酸菌的好菌，環境或飲食等外在問題，都可能造成私密處乳酸菌不平衡，因而引起感染。所以若要拒絕私密處感染，首要條件便是可以補充「益生菌」。
參考資料:http://topic.uho.com.tw/probiotics/
http://www.healthhy.com.tw/?p=3613